Quel est l'effet du type de milieu sur l'abondance des escargots et des limaces ?

Objectif du scénario

Répondre à la question : Le type de milieu a-t-il un effet sur l'abondance des escargots et des limaces ?

Compétence développées :

• Calcul d'abondance
• Représentation graphique
• Test statistiques

Déroulement de l'analye étape par étape

 

1. Poser la question de recherche

Dans cet exemple, nous vous donnons déjà la question de recherche. Vous pouvez noter : "Abondance et type de milieu" comme nom d'analyse par exemple et "Quel est l'effet du type de milieu sur l'abondance des escargots et des limaces ?" dans la partie question de recherche.

2. Importer les données

Afin de répondre à cette question, nous allons avoir besoin des données de Vigie-Nature École relatives à l'observatoire Opération Escargots.

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3. Manipuler les données

Maintenant que vous avez toutes les données, il va falloir les résumer car il y a plus de 50 000 lignes. Nous allons commencer par calculer l'abondance totale des escargots vus lors de chaque observation. Pour cela, nous allons faire la somme des individus observés en regroupant les données par numéro d'observation (pour ne pas additionner toutes les observations entre elles) et le type de milieu (pour garder cette colonne associée avec nos valeurs et pouvoir répondre à notre question).

↓ Comment faire concrètement ↓

Nous allons maintenant regrouper les données par type de milieu. Cette fois nous allons faire une moyenne pour avoir une valeur qui représente le nombre moyen d'escargots et de limaces par type de milieu.

↓ Comment faire concrètement ↓

4. Visualiser les données

Normalement, en regardant votre tableau, vous pouvez déjà voir qu'il existe des différences entre le milieu urbain et les autres types de milieux. Toutefois, afin de mieux voir les différences, on peut réaliser un graphique. Ici, la colonne type de milieu est qualitative (on ne peut pas faire d'opération avec ces valeurs) et la colonne Abondance moyenne est quantitative (on peut faire des opérations avec ses valeurs). Une représentation adaptée est donc le diagramme en barre avec l'type de milieu sur l'axe des X et l'Abondance moyenne sur l'axe des Y.

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↓ Voir le résultat ↓

La différence est plus visible encore qu'avec le tableau. Maintenant, il faut savoir si la différence que l'on observe n'est pas que due au hasard.

5. Test statistique

Nous allons donc faire un test statistique afin de voir si le type de milieu explique la différence observée entre le milieu urbain et les deux autres environnement. Comme nous l'avons déjà expliqué plus haut, la colonne environnement est qualitative et la colonne Abondance est quantitative. Il faut donc faire une comparaison de moyenne. Dans cet outil, attention à bien selectionner le jeu de données qui a servi à faire la moyenne (ici il s'agit de "somme sur la colonne 9 en fonction de la colonne 1,10.csv").

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6. Conclusion

Je conclue que le type de milieu a bien un effet sur l'abondance. Les escargots et les limaces semblent être moins nombreux en milieu rural.

7. Rapport

Vous pouvez maintenant télécharger votre rapport au format pdf

Pour aller plus loin

Ce scénario peut-être adapté pour se poser d'autres questions.

• Par exemple il est possible de se poser la même question pour d'autres organismes en changeant l'observatoire sur lequel on travaille il faut juste qu'il y a une colonne environnement et un nombre d'individu.
• Il est aussi possible de se poser la même question pour une autre colonne comme la distance au bois le plus proche par exemple.
• Une autre possibilité est encore de calculer la diversité plutôt que l'abondance totale des escargots (en comptant le nombre de lignes par observation).